剧情介绍：
《游戏王-怪兽之决斗》改写自漫画《游戏王》，于2000-2004年之间在东京电视台播出。故事以漫画剧情为主，但由于中途漫画故事情节进度跟不上，故加插少量漫画没有的剧情和人物。此举为脱离“原作”独立创作故事奠定下根底。
决斗者王国篇
一卷奥秘的录像带，千年神器中千年眼的拥有者，贝卡斯·J·克罗佛多在录像带中运用黑暗决斗向武藤游戏应战，但武藤游戏却由于工夫终止而败北，武藤双六的灵魂也因而被千年眼的力气封印在灵魂封印卡中（漫画版为贝卡斯寄给游戏的录像带），武藤游戏为了救回灵魂被囚禁的爷爷，与同伴们前往决斗者王国找贝卡斯决斗，与互信的同伴们以及心中的另一个本人并肩作战。
战役城市前篇
决斗者王国一战完毕，武藤游戏的知名度霎时上升，奥秘的埃及石板离开日本展览，牵扯出千年神器的机密、三千年前的战役、三张神之卡，还有隐藏在千年积木中的无名法老王的记忆，海马濑人在一个机缘下失掉了神之卡的其中一张：欧贝利斯克的巨神兵，而他为了失掉剩余的二张神之卡，在童实野市举行了战役城市大赛，并且以赌牌当作规则，同时新的次世代决斗盘也跟着亮相，而武藤游戏为了寻觅心中的另一个本人的记忆，也就是无名法老王的记忆，必需搜集三张神之卡，也参与了这场大赛，各路好手为了搜集六张拼图卡，失掉最初的参赛权，纷繁展开决斗；奥秘的古鲁斯集团派出的蕾雅卡猎人也参杂其中。
乃亚篇（动画原创）
战役飞行船行驶人工岛的途中，飞行船零碎却蒙受到外来的入侵改写了零碎，因此改动了航线，阻挠在武藤游戏等人面前的这个宏大机动要塞终究是什么？而又呈现了奥秘的人，自称是“五巨头”，他们还要武藤游戏等人的身体，一场赌上各兽性命的决斗，而他们又发现五大老的头，叫乃亚的小孩，却是刚三郎（海马的养父）的儿子！！一场大战行将展开。
战役城市后篇
战役城市最终决战开端，每个决斗者都各自有战役的理由，城之内为了成为真正的决斗者、救出被马利克停止黑暗游戏惩罚的孔雀舞，海马为了与宿敌游戏决斗、为了根除可爱的古鲁斯首脑并失掉太阳神、为了完成海马乐园的梦想，游戏为了完成与城之内的诺言、与海马宿命的对决、救出被暗马利克施予黑暗游戏惩罚的人们、更为了本人遗失的记忆，他向马利克宣战。
多玛篇（动画原创）
战役城市完毕后，武藤游戏蒙受到了不知名力气的阻挠，而三张神之卡也被名为多玛三剑客的人抢走，这个奥秘的多玛组织抢走神之卡的目的终究是什么，奥秘的卡片——“奥利哈刚的结界”拥有的黑暗能量，又会带给运用这张卡片的人什么样的改动；黑魔导女孩从精灵的世界来临，向武藤游戏恳求援助，人类世界与精灵世界的命运会如何，无名的传说之龙又会怎样样的协助游戏等人。
海马集团大赛篇（动画原创）
多玛事情完毕后，武藤游戏和同伴因没钱回不到日本，无法之下恳求海马公司，却鬼使神差的参与了海马集团为维护名誉的竞赛。全世界的决斗者聚集在这，一场别开生面的竞赛就此展开。
王之记忆篇
为了寻觅寄宿在千年积木中无名法老王灵魂的真实姓名与记忆，武藤游戏与冤家们踏上了埃及之旅，在记忆石板的面前，解开了无名法老王的过来记忆，暗貘良也趁此时跃跃欲试，应用了千年智慧轮的黑暗力气，在千年积木内停止了一场黑暗RPG，这场黑暗RPG游戏中，直接以无名法老王的记忆当作背景，暗游戏必需从这场黑暗游戏中找回本人的真实姓名、得知本人的过来，并且打败大邪神佐克，再一次封印，否则大邪神佐克也会在理想世界中复生。
共有224集。
