工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
剧情介绍：
阳黑暗媚的一天，东都体育场正停止一场东京Spirit和大阪钢巴的精彩足球竞赛，江户川柯南（平地南 配音）、灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士以及少年侦探团的同伴们齐齐到场呼吁助威。城市的另一边，事务所内的毛利小五郎（小山力也 配音）却接到一通恐惧袭击的电话。经过一番努力，小兰（山崎和佳奈 配音）终于摆脱新一解开了犯人留下的暗语，成功解救了有数人的生命。在此之后，警方和毛利一方锁定了数名嫌疑人，并随之展开调查。与此同时，躲在暗处的犯人持续筹划新一轮的袭击，史无前例的大应战，分秒必争的对决，裹挟着有数仇恨的袭击强势袭来……
本片为日本J联赛创建20周年岁念作品，现役选手三浦知良、远藤保仁、今野泰幸、楢崎正刚、中村宪刚等人为片中自己的抽象配音。
